O Instituto Arco-Íris trabalha junto com uma rede de apoio. São entidades do setor público, privado, empresas, pessoas.
Universidade Federal de Santa Catarina – UFSC
Proprietária da sede do Instituto Arco-Íris, que cedeu o espaço para o Instituto.
Prefeitura Municipal de Florianópolis
Convênios com a Prefeitura através da Secretaria Municipal de Saúde.
Governo do Estado de Santa Catarina
Convênio com a Secretaria de Segurança Pública.
De Bem Comunicação
Empresa de comunicação e marketing, responsável pelo novo planejamento de marketing do Instituto, criação e manutenção do site, blog, Instagram e manutenção do Facebook.
Instituto Arco-Íris de Direitos Humanos 